学校认为，课程是素质教育的主载体。为此，学校借新课改的东风，成立了课程改革处，专业指导课程开发。学校派出40多名骨干教师赴北京等全国各地参加培训，回校后开设100多门选修课，自编教材，具有多样性、科学性、实用性特点。学生进行研究性学习，自选研究课题。高2004级自选100多项课题，将其成果向全市40多个区县汇报展示，受市教科院和各方好评，获研究性课程一等奖。高2005级124个课题，初2004级和初2005级共170余项研究性学习成果，现场会也在巴蜀召开，充分展示了巴蜀中学超一流的能力和水平。在重庆市2010年高中全面进入课程改革之际，学校抓住机遇，当很多学校还在摸索犯难之际，巴蜀中学又一次走在了最前列，在2011年成功构建了独具特色的巴蜀中学“131”校本课程体系，打造了全国中学领先的财商教育特色课程，推出了由重庆出版社向全国出版发行的《影响中学生财商的26堂课》财商教材。截止目前，学校开发了以传统文化教育为价值核心，已自编系列文本《优雅少女教程》》《正气歌》《祖国颂》等。其中“优雅少女俱乐部”“俊朗少年训练营”“财商教育”成为最耀眼的校本课程。学校“131”校本课程体系的构建与实施，受到人民网、中新社、中国教育报、重庆日报、重庆晨报、大渝网等国内外报刊传媒高度关注，高频率发表了200余篇新闻报道，《人民教育》2013年第8期发表了近5000字的文章《发掘?确立?打磨?提升——重庆巴蜀中学在城市中学学校文化建设中的策略》，《学校党建与思想建设》2012年第12期以5000余字的篇幅向全国介绍了财商教育的探索与实践，《课程?教材?教法》2013年第3期发表文章以7000余字介绍了“131”校本课程体系，将巴蜀的课程改革推上了重庆市乃至全国教改的潮头浪尖，充分发挥了作为中华名校的示范引领作用。

　　近年来，学校先后承担了10余项国家级、省市级科研课题，如《适应高中新课程改革的教师专业化发展研究》《财商教育校本教材研究》《基于巴蜀中学的学校文化建设》等，以此为平台吸引了300余位教师参加，提高教师教育教学科研能力，为学校的可持续发展奠定了坚实基础。其中《教师在研究性学习中的作用研究》课题荣获重庆市政府二等奖和教育部三等奖。

　　2013年重庆小升初重庆巴蜀中学择校费与2012年相比，有所增长（另：2013年重庆小升初公立学校一般不再收取择校费）。

　　重庆巴蜀中学本部校区菜品丰富，有大锅饭，小炒，套饭，炒饭，早餐等（可为忘带餐具或要带走的师生提供一次性餐具），价格适中，烧菜价格在3元左右，小炒10元左右一份，炒饭5元，套饭8元。为了健康以及方便师生用餐，食堂使用校园卡，食堂左侧有续卡室，提供校园卡充值及挂失业务，食堂内还经营各式糕点、牛奶、瓶装水等；还有专门的小吃区，经营面食、米线、烤肠、煎饼、肉串等特殊小吃；二楼食堂经营大锅菜，汤锅火锅、盖饭、早餐等。